Enola Holmes non include l'assistente investigativo di Sherlock, il dottor John Watson, ma gli viene dato un sottile riferimento durante la trama del film. Dal momento che il film segue Enola mentre tenta di scoprire dove si trova la madre scomparsa Eudoria (Helena Bonham Carter) e avvia la sua agenzia investigativa nel clima patriarcale dell'Inghilterra vittoriana, la maggior parte dei personaggi iconici del materiale originale di Arthur Conan Doyle, incluso Mycroft (Sam Claflin), Lestrade (Adeel Akhtar) e Sherlock (Henry Cavill) stesso, interpretano ruoli antagonisti secondari come ostacoli da superare per Enola durante la sua indagine.
Mentre la prima indagine canonica di Sherlock e Watson Uno studio in scarlatto si svolge nel 1881, Enola Holmes suggerisce che il dinamico duo non si è ancora incontrato nonostante sia ambientato nel 1884. In più occasioni, il fratello maggiore di Enola, Sherlock, è descritto come un solitario. Quando Enola si atteggia a assistente di Sherlock per visitare la tenuta di Tewkesbury, l'ispettore Lestrade afferma che Sherlock lavora sempre da solo. Quando Sherlock fa visita a Edith Grayston (Susan Wokoma) nel suo negozio di tè, afferma che Sherlock ha niente amici, solo una strana occupazione. Quando Enola sta fornendo un'esposizione sulla sua vita, un ritaglio di giornale chiama Sherlock a giovane detective, il che lo suggerisce Enola Holmes segue Sherlock durante i sei anni in cui ha lavorato come detective senza Watson. Mentre Watson non è fisicamente presente durante Enola Holmes , il leggendario dottore viene brevemente accennato attraverso un indizio lasciato da Eudoria.
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Quando la madre di Enola, Eudoria, scompare all'inizio di Enola Holmes , lascia dietro di sé un pacco pieno di indizi che Enola deve decifrare. All'interno di quel pacchetto, Enola scopre uno dei puzzle di parole di sua madre: un foglietto di carta stampato con una serie di lettere casuali che Enola decodifica per leggere Enola, guarda nei miei crisantemi. Seguendo l'indizio, Enola esamina attentamente IL Il linguaggio dei fiori libretto che sua madre ha lasciato e scopre che i crisantemi simboleggiano attaccamento familiare E affetto. Dopo aver cercato il vaso di crisantemi nella camera da letto di sua madre e non aver trovato nulla, Enola capisce che sua madre si riferiva alle immagini di crisantemi che aveva dipinto. Mentre questo indizio porta Enola a scoprire la busta di denaro nascosta nel dipinto di Eudoria che fornisce i fondi per il suo viaggio e dà il via alla trama, un indizio simile funge da catalizzatore all'interno di un altro Enola Holmes libro coinvolgendo il dottor Watson.
In Il caso dei mazzi bizzarri: un mistero di Enola Holmes, Enola scopre che il partner di Sherlock, il dottor Watson, è stato imprigionato in un manicomio dopo aver inviato un messaggio attraverso un mazzo di fiori. Decidendo di aiutare Sherlock risolvendo la scomparsa del dottor Watson, Enola fa visita alla signora Watson sotto lo pseudonimo di Viola Everseau e osserva che uno strano mazzo di fiori inviato a casa loro simboleggia la morte. Rintracciando il bouquet in un negozio di costumi, Enola svela che la sorella del proprietario del negozio, Flora, era una paziente del Dr. Watson, che ha autorizzato ad essere ricoverata in manicomio. Per vendetta, Flora ha ingannato i dipendenti del manicomio facendogli ammettere Watson sotto il nome di un cognato che ha ucciso. Data la sua conoscenza del linguaggio dei fiori e l'esperienza di Watson come orticoltore, Enola alla fine decifra il grido di aiuto di Watson e informa Sherlock di dove si trova.
Mentre l'uovo di Pasqua di Watson è dentro Enola Holmes si perde facilmente, aggiunge un altro livello di profondità al film, in particolare per quanto riguarda la dinamica di Sherlock ed Enola. Quando Sherlock ed Enola parlano della scomparsa di Eudoria, Sherlock suggerisce a Enola di smetterla di essere inutilmente emotiva e di svelare il mistero cercando la verità. La loro conversazione mostra che Sherlock vede la ragione e l'emozione come ideali opposti, dal momento che crede che i sentimenti personali di Enola le stiano impedendo di risolvere il mistero. Tuttavia, Enola risolve la cifra di Eudoria i miei crisantemi utilizzando la sua conoscenza personale di sua madre mentre Sherlock, seguendo nient'altro che la scia di prove per condurlo al dipinto, è un passo indietro rispetto a Enola. Dal momento che Sherlock non comprende veramente l'importanza di formare relazioni fino a quando Watson non entra nella sua vita, l'indizio del bouquet nel film Enola Holmes evidenzia efficacemente i punti di forza di Enola e le debolezze di Sherlock come detective senza Watson.
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